Трансректальна інтубація кишківника, як правило, доповнює проведену раніше трансназальну декомпресію. Вона абсолютно показана при резекції сигмоподібної ободової кишки з накладанням первинного анастомозу. Як самостійний метод трансректальну декомпресію застосовують у дитячій хірургії.